MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 plasmid pCE10A

Total Repeats: 277

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017647	A	6	6	775	780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017647	GTA	2	6	783	788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017647	GAG	2	6	820	825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017647	CTT	2	6	1101	1106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017647	TGGC	2	8	1156	1163	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017647	CGA	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017647	AGA	2	6	1257	1262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017647	CAA	2	6	1292	1297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017647	CTT	2	6	1344	1349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017647	GCTC	2	8	1355	1362	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017647	CCT	2	6	2255	2260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017647	AAT	2	6	2264	2269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017647	GGA	2	6	2282	2287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017647	A	7	7	2317	2323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017647	CAC	2	6	2327	2332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017647	A	6	6	2337	2342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017647	TCA	2	6	2348	2353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017647	TC	3	6	2376	2381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017647	ACT	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017647	CTC	2	6	2724	2729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017647	GCCCC	2	10	2744	2753	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
22	NC_017647	TGT	2	6	2793	2798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017647	CTGG	2	8	2828	2835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017647	TCG	2	6	2912	2917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017647	CT	3	6	2943	2948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017647	ATCA	2	8	3003	3010	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017647	CGG	2	6	3032	3037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017647	GGT	2	6	3187	3192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017647	TC	4	8	3194	3201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017647	T	6	6	3234	3239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017647	GGT	2	6	3260	3265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017647	ATC	2	6	3275	3280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017647	ATCTG	2	10	4378	4387	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017647	TGA	2	6	4396	4401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017647	TCA	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017647	TCA	2	6	4514	4519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017647	TC	3	6	4541	4546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017647	T	7	7	4554	4560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017647	CAGA	2	8	4570	4577	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017647	AAT	2	6	4624	4629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017647	T	6	6	5342	5347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017647	TGC	2	6	5401	5406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017647	T	6	6	5407	5412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017647	TTA	2	6	5424	5429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017647	T	6	6	5430	5435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017647	TGAA	2	8	5488	5495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017647	CTGC	2	8	6348	6355	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017647	AAT	2	6	6364	6369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017647	GCCT	2	8	6408	6415	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017647	TG	4	8	6472	6479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017647	TCA	2	6	6481	6486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017647	TGA	2	6	6492	6497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017647	GTC	2	6	6516	6521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017647	ATA	2	6	6572	6577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017647	GTT	2	6	8563	8568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017647	AGG	2	6	9138	9143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017647	CCG	2	6	9200	9205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017647	ACG	2	6	14179	14184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017647	GA	3	6	14191	14196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017647	TCT	2	6	14714	14719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017647	AAC	2	6	14790	14795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017647	T	6	6	15558	15563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017647	CCA	2	6	15564	15569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017647	ATG	2	6	16603	16608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017647	T	6	6	18514	18519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017647	GT	3	6	18556	18561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017647	GA	3	6	18563	18568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017647	A	6	6	18826	18831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017647	GCT	2	6	18887	18892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017647	AAT	2	6	18945	18950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017647	ACT	2	6	19043	19048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017647	AAT	2	6	19050	19055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017647	ACAA	2	8	19066	19073	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017647	ATT	2	6	19136	19141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017647	GCG	2	6	19210	19215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017647	T	6	6	19298	19303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017647	C	7	7	19304	19310	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NC_017647	AG	3	6	20517	20522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017647	TAA	2	6	22840	22845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017647	ATTA	2	8	22868	22875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017647	T	7	7	22895	22901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017647	AAATT	2	10	22943	22952	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017647	ATTA	2	8	24692	24699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017647	GAAT	2	8	24715	24722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017647	CAA	2	6	24741	24746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017647	GCTT	2	8	24855	24862	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017647	GAA	2	6	24933	24938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017647	CGGC	2	8	24941	24948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017647	G	6	6	24949	24954	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017647	GC	3	6	24961	24966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017647	T	6	6	25549	25554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017647	CCAG	2	8	25628	25635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017647	GTTT	2	8	25685	25692	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017647	TACAC	2	10	25703	25712	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017647	GTAC	2	8	25773	25780	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017647	A	6	6	25813	25818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017647	TC	3	6	25960	25965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017647	ATT	2	6	26009	26014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017647	ACC	2	6	26085	26090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017647	ATTT	2	8	26114	26121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017647	TAA	2	6	26182	26187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017647	CAA	2	6	26210	26215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017647	A	7	7	26214	26220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017647	T	6	6	26284	26289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017647	CTG	2	6	26342	26347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017647	ATCT	2	8	26398	26405	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017647	AT	3	6	26433	26438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017647	AAT	2	6	26441	26446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017647	AGC	2	6	26451	26456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017647	TAA	2	6	26491	26496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017647	ATT	2	6	26509	26514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017647	AAG	2	6	26520	26525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017647	T	6	6	26547	26552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017647	TAT	2	6	26599	26604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017647	ATA	2	6	26614	26619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017647	GAA	2	6	26676	26681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017647	AGAA	2	8	26757	26764	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017647	AAAATA	2	12	26865	26876	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017647	AAC	2	6	26926	26931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017647	TAA	2	6	27007	27012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017647	TAAA	2	8	27091	27098	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017647	CAT	2	6	27556	27561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017647	CGT	2	6	28712	28717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017647	ATCC	2	8	30029	30036	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017647	TCA	2	6	31403	31408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017647	AT	3	6	33393	33398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017647	TTA	2	6	33429	33434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017647	TGA	2	6	34180	34185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017647	AGG	2	6	34247	34252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017647	AT	3	6	34292	34297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017647	ATTT	2	8	34303	34310	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017647	CAG	2	6	34341	34346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017647	AT	3	6	34355	34360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017647	GGT	2	6	34402	34407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017647	GTT	2	6	34430	34435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017647	TAT	2	6	34439	34444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017647	AAC	2	6	34469	34474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017647	TA	3	6	34528	34533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017647	CTA	2	6	34548	34553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017647	TACT	2	8	34559	34566	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017647	TCTAT	2	10	34582	34591	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017647	ATA	2	6	34622	34627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017647	CTCC	2	8	34633	34640	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_017647	A	8	8	34737	34744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017647	CAT	2	6	34745	34750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017647	TGCCTA	2	12	34830	34841	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017647	A	7	7	34841	34847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017647	AC	3	6	34857	34862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017647	ATA	2	6	34996	35001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017647	TCAT	2	8	35026	35033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017647	TTA	2	6	35058	35063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017647	TCAT	2	8	35080	35087	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_017647	TAAAA	2	10	35088	35097	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017647	TAT	2	6	35112	35117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017647	TCT	2	6	35159	35164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_017647	TCAT	2	8	35168	35175	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
157	NC_017647	T	6	6	35204	35209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017647	GATG	2	8	35240	35247	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017647	GT	3	6	35252	35257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017647	AT	3	6	35308	35313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017647	G	6	6	35328	35333	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017647	AAAT	2	8	35412	35419	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017647	ATT	2	6	35437	35442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017647	GGT	2	6	35524	35529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017647	AT	3	6	35531	35536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017647	TA	3	6	35582	35587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017647	TCA	2	6	35595	35600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_017647	AAT	2	6	35621	35626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017647	CAAGT	2	10	35674	35683	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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172	NC_017647	TTA	2	6	36968	36973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_017647	GTAA	2	8	37057	37064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017647	ATTT	2	8	37077	37084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_017647	TCG	2	6	37087	37092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_017647	ATA	2	6	37095	37100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_017647	TTA	2	6	37223	37228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_017647	TA	3	6	38351	38356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_017647	CATAA	2	10	38378	38387	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
190	NC_017647	GCA	2	6	38470	38475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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192	NC_017647	TC	3	6	38549	38554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
193	NC_017647	GAC	2	6	39540	39545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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274	NC_017647	AGA	2	6	53019	53024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
275	NC_017647	GGAA	2	8	53070	53077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
276	NC_017647	TCAT	2	8	54014	54021	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
277	NC_017647	TAAT	2	8	54263	54270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.